No Colegião, Escola de Educação Básica Engenheiro Sebastião Toledo dos Santos, temos mais de 40 salas de aulas. As salas de aulas possuem capacidade média de 28 alunos. O ambiente da escola conta com 8 salas temáticas, tendo atelier de artes, laboratório de química, física, biologia e sala especial do magistério, além disso a instituição conta com farta estrutura física.

A biblioteca vem ganhando livros novos recentemente tendo vários títulos e categorias terror, aventura, ação, romance, até de atores famosos tipo o Stephen King o criador de "It, a coisa" e até livros em quadrinhos como o tio patinhas e puffs para acomodação e leitura.

A sala de informática é equipada com 30 computadores, todos novos e de última geração. Nas aulas os alunos aprendem a editar textos, planilhas e apresentações, além de servir como laboratório de pesquisa para todos os componentes curriculares.

Temos mais de 36 mesas, com capacidade de 4 a 5 alunos, isso somente em uma bancada, além de um palco, onde a maioria dos eventos do Colegião é realizado.

O programa Ensino Médio Inovador – EMI foi instituído pela Portaria nº 971, de 9 de outubro de 2009, no contexto da implementação das ações voltadas ao Plano de Desenvolvimento da Educação – PDE. A edição atual do Programa está alinhada às diretrizes e metas do Plano Nacional de Educação 2014-2024 e à reforma do Ensino Médio proposta pela Medida Provisória 746/2016 e é regulamentada pela Resolução FNDE nº 4 de 25 de outubro de 2016.

É uma sala reservada para os professores do Ensino Médio, onde podem rever as materiais e descansar graças aos sofás, contendo internet e uma cafeteira.